Θεολόγος και συγγραφέας εκκλησιαστικών μελετών. Γεννήθηκε στον Καραβά το 1874. Αποφοίτησε από το Παγκύπριο Διδασκαλείο το 1896 και συνέχισε τις σπουδές του στην Αθήνα με υποτροφία του μητροπολίτη Κερύνειας Κυρίλλου Βασιλείου, του μετέπειτα αρχιεπισκόπου Κύπρου Κυρίλλου Γ' (1916-1933). Στην ελληνική πρωτεύουσα αρχικά συμπλήρωσε τις γυμνασιακές του σπουδές και ακολούθως ανηγορεύθη διδάκτωρ της Θεολογικής Σχολής του Πανεπιστημίου Αθηνών (1901).
Μετά το τέλος των σπουδών του επέστρεψε στην Κύπρο και υπηρέτησε ως ιεροκήρυκας στη μητρόπολη Κερύνειας και την Αρχιεπισκοπή (1902-1907), καθώς και ως καθηγητής στο Παγκύπριο Γυμνάσιο και Διδασκαλείο (1903-1921 και 1923-1935). Το 1905 διορίστηκε από την κυβέρνηση και ως υπεύθυνος για τη θρησκευτική και γενική διδασκαλία στις φυλακές.
Ο Ιωάννης Παπαπορφυρίου δημοσίευσε πολλές μελέτες στην εφημερίδα «Φωνή της Κύπρου» με τις υπογραφές Θ. και Ι.Π. Κατά το χρονικό διάστημα 1913-1914 εξέδωσε το 15ήμερο εκκλησιαστικό περιοδικό «Πίστις», ενώ από το 1918 έως το 1924 διετέλεσε διευθυντής του περιοδικού της Εκκλησίας της Κύπρου «Απόστολος Βαρνάβας». Εξέδωσε επίσης δύο βιβλία: α) «Λόγοι καί ὁμιλίαι θρησκευτικαί», Λευκωσία, 1905, και β) «Λόγοι καί μελέται» (ανατύπωσις εκ του περιοδικού «Πίστις»), Λευκωσία, 1945. Το τελευταίο κυκλοφόρησε μετά το θάνατό του με επιμέλεια του αρχιμανδρίτη Παρθενίου Κυρμίτση.
Ο Ιωάννης Παπαπορφυρίου πέθανε το 1945.