Στον αρχιεπίσκοπο Μακάριο απενεμήθησαν κατά καιρούς πλήθος παράσημα, μετάλλια και τιμητικές διακρίσεις:
- Μεγαλόσταυρος του Τάγματος των Αποστόλων Πέτρου και Παύλου, του πατριαρχείου Αντιοχείας.
- Μεγαλόσταυρος του Τάγματος του Βασιλέως Γεωργίου Α΄ της Ελλάδος.
- Μεγαλόσταυρος του Τάγματος του Σωτήρος της Ελλάδος.
- Μεγαλόσταυρος της Ομοσπόνδου Γερμανικής Δημοκρατίας.
- Μεγαλόσταυρος του Τάγματος Μπόγιακα Κολομβίας.
- Μεγαλόσταυρος του Τάγματος της Αγίας Αικατερίνης, της μονής Σινά.
- Μεγαλόσταυρος της Φιλλανδικής Επικρατείας.
- Ανώτατο Χρυσούν Παράσημο του Νείλου, της Ηνωμένης Αραβικής Δημοκρατίας.
- Ανώτατο Χρυσούν Παράσημο της Αιθιοπίας.
- Παράσημο του Αγίου Βλαδιμήρου, του πατριαρχείου Ρωσίας.
- Παράσημο Manuel Ammador Guerrero, του Παναμά.
- Παράσημο The National Order of Merit and The Great Collar, του Ισημερινού.
- Διάσημα του Μεγάλου Σταυροφόρου, του Τάγματος των Ορθοδόξων Σταυροφόρων του Παναγίου Τάφου.
- Χρυσούν Μετάλλιον, του Δήμου Αθηναίων.
- Χρυσούν Μετάλλιον, του Δήμου Θεσσαλονίκης.
- Χρυσούν Μετάλλιον, του Δήμου Νέας Υόρκης.
- Χρυσούν Μετάλλιον, του Δήμου Μπογκοτά.
- Χρυσούν Μετάλλιον, του Δήμου Σαντιάγο.
Επίσης διάφορες άλλες τιμητικές διακρίσεις δέχθηκε από Κράτη, κυβερνήσεις, Εκκλησίες και οργανισμούς. Μεταξύ των διαφόρων πόλεων που τον τίμησαν, τον ανακήρυξαν επίτιμο δημότη τους: η Νέα Υόρκη, η Νέα Ιερσέη, το Ντητρόιτ, η Μπογκοτά.
Ακόμη, απονεμήθηκαν στον Μακάριο οι ακόλουθοι τίτλοι από διάφορα Πανεπιστήμια:
- Επίτιμος Διδάκτωρ της Θεολογίας, του Πανεπιστημίου της Βοστώνης.
- Επίτιμος Διδάκτωρ της Θεολογίας, του Πανεπιστημίου Αθηνών.
- Επίτιμος Διδάκτωρ της Νομικής, του Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης.
- Επίτιμος Διδάκτωρ της Νομικής, του Πανεπιστημίου Κεράλα των Ινδιών.
- Επίτιμος Διδάκτωρ της Νομικής, του Πανεπιστημίου Χοσέ Τατέο Λοζάνο της Κολομβίας.
- Επίτιμος Διδάκτωρ της Νομικής, του Πανεπιστημίου της Μάλτας.
- Επίτιμος Διδάκτωρ των Πολιτικών Επιστημών, της Παντείου Ανωτάτης Σχολής Πολιτικών Επιστημών των Αθηνών.