Συγγενής του Μάρκου Αντωνίου Κολόννα. Κατά την αποτυχημένη ναυτική εκστρατεία για βοήθεια της Κύπρου που κινδύνευε άμεσα από την τουρκική επίθεση του 1570 (βλέπε αμέσως προηγούμενο λήμμα), ο Πομπήιος Κολόννα είχε πάρει μέρος. Ο Μάρκος Αντώνιος Κολόννα, ο οποίος είχε διοριστεί αρχηγός της ναυτικής δύναμης του πάπα Πίου Ε' που μετείχε στην εκστρατεία, διόρισε τον Πομπήιο Κολόννα ως υπαρχηγό του. Ο τελευταίος έφερε τον τίτλο του δούκα του Καζαρουόλο.